Da eine längerfristige Verabreichung von Calcitonin mit einem erhöhten Krebsrisiko verbunden ist, soll das Medikament gemäss der europäischen Arzneimittelbehörde EMA nur noch in Ausnahmefällen verordnet werden. Dazu gehören die Gabe bei plötzlicher Immobilisation, um einen Knochenabbau zu verhüten (max. 2 bis 4 Wochen), die Behandlung bei Morbus Paget, wenn keine Alternativen in Frage kommen (in der Regel max. 3 Monate), sowie die tumorbedingte Hyperkalzämie.